1、以增施有机肥和补充种微量元素为主，适当控制化肥的使用量，有机肥肥效持久，有利保苗、发根、促进生长。一般碱性稻田可以选用酸性肥料，如过磷酸钙，硫酸型肥料，含盐较高田地可施用生理中性肥料，盐碱地施用化肥应分多次施用。
2、盐碱地增加磷肥的施用量，磷肥的有效性与土壤酸性密度有密切的关系。盐碱地水田要以补锌为主的中量元素。盐碱地缺锌现象很普遍，容易产生缩苗，因此盐碱地稻田可在基肥或分蘖肥补施含锌的中微量元素。
3、应深施肥选用颗粒较大的肥料，总肥料的80百分之作为深施基肥，20百分之作为分蘖、穗肥施用。